昆蟲標本是分類研究中重要的存證證據，本館目前典藏數量最豐富的標本，主要有兩個類群：張書忱教授的天牛標本，以及楊仲圖教授針對半翅目木蝨總科及飛蝨總科類群進行研究時所採集的標本。近年來，仍然有不少昆蟲的身世仍是有待解密!較不醒目的昆蟲如在植物上造癭生存的膜翅目癭蜂及雙翅目癭蚋，其基礎的物種資訊、與寄主植物物候搭配的生活史、寄生生物相等，都是鮮少人進行的研究類群。而本系對於蝽象、木蝨、步行蟲等類群的昆蟲，亦持續進行其研究。因此除了搭配在台灣各地區普遍的採集以外，還需至其他館甚至是國外標本館，參考其他的研究標本以輔佐釐清其分類狀況。